Обычно для такого заболевания как хламидиоз лечение продолжается три-четыре недели. Кроме того, после завершения курса лечения необходимо ещё некоторое время (оно также определяется врачом по итогам обследования и может составлять от одного до двух месяцев) наблюдения. В том случае, если после завершения периода контроля хламидии не обнаруживаются, можно считать лечение успешным.

Обычно при таком диагнозе как хламидиоз лечение заключается в курсе антибиотиков, неспецифических средств, а также физиотерапии. В значительной степени и продолжительность и комплексность лечения определяется областью  и степенью поражения, что может определить только врач после соответствующего обследования.

В том случае, если хламидиоз диагностирован на стадии острой инфекции, правильно подобранное лечение даёт возможность быстро купировать и ликвидировать заболевание. Если же диагноз поставлен на хронической стадии или пациент пытался заниматься самолечением (а в этом случае чаще всего препараты подбираются неверно), существует риск перехода заболевания в хроническую стадию. В случае запущенного хронического хламидиоза существует риск обострения различных воспалительных процессов по всему организму, а в мочеполовой системе эти воспаления и нечувствительность инфекции к антибиотикам, которая также нередко отмечается на хронической стадии, могут привести к серьёзным расстройствам вплоть до бесплодия.

Существует несколько основных методов лечения хламидиоза: антибактериальный, эубиотический, энзимотерапия, иммуномодулирующая терапия, патогенетическая терапия. Кроме того, при наличии неспецифической резистентности организма, терапия должна быть комплексной и подбираться строго индивидуально.

Антибактериальный или этиотропный метод лечения, вопреки существующему предубеждению, не является единственным. Более того, только комплексный подход к такому заболеванию как хламидиоз лечение может сделать действительно эффективным. Что касается иммуномодуляторов, то они наиболее эффективны в период контроля, после прохождения основного курса лечения, либо как сопутствующая терапия.